Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrkczQ02956 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkczQ02956 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms