Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NfiaQ02780 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NfiaQ02780 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NfiaQ02780 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms