Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax5Q02650 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax5Q02650 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms