Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nhlh1Q02576 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nhlh1Q02576 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms