Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HmgcrQ01237 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmgcrQ01237 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HmgcrQ01237 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HmgcrQ01237 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms