Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrcdQ00LT2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PrcdQ00LT2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms