Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Serpina1cQ00896 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Serpina1cQ00896 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms