Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rbp4Q00724 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp4Q00724 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms