Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SeleQ00690 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SeleQ00690 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms