Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Il6stQ00560 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Il6stQ00560 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms