Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GabpaQ00422 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GabpaQ00422 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GabpaQ00422 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms