Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VldlrP98156 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VldlrP98156 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms