Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IhhP97812 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IhhP97812 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IhhP97812 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IhhP97812 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IhhP97812 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IhhP97812 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IhhP97812 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IhhP97812 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
IhhP97812 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IhhP97812 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IhhP97812 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IhhP97812 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IhhP97812 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IhhP97812 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms