Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gfra1P97785 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gfra1P97785 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms