Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nkx3-1P97436 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nkx3-1P97436 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms