Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp1b3P97370 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp1b3P97370 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp1b3P97370 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms