Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tubg1P83887 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tubg1P83887 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms