Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NyxP83503 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NyxP83503 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NyxP83503 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NyxP83503 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NyxP83503 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NyxP83503 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NyxP83503 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NyxP83503 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NyxP83503 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NyxP83503 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NyxP83503 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NyxP83503 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NyxP83503 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NyxP83503 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NyxP83503 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NyxP83503 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NyxP83503 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NyxP83503 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NyxP83503 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NyxP83503 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NyxP83503 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NyxP83503 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms