Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Otx1P80205 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx1P80205 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx1P80205 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Otx1P80205 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Otx1P80205 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Otx1P80205 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms