Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casp3P70677 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp3P70677 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casp3P70677 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Casp3P70677 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms