Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ErfP70459 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ErfP70459 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ErfP70459 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ErfP70459 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ErfP70459 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ErfP70459 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ErfP70459 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ErfP70459 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ErfP70459 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms