Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad50P70388 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad50P70388 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad50P70388 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rad50P70388 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad50P70388 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms