Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aup1P70295 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aup1P70295 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Aup1P70295 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Aup1P70295 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms