Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp7P70280 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp7P70280 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms