Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Traf5P70191 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Traf5P70191 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Traf5P70191 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms