Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.99
Abcc9P70170 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Abcc9P70170 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Abcc9P70170 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Abcc9P70170 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms