Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabrb3P63080 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabrb3P63080 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms