Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uba52P62984 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Uba52P62984 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms