Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps3P62908 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rps3P62908 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rps3P62908 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms