Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gnb1P62874 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms