Protein–RNA interactions for Protein: P62827

Ran, GTP-binding nuclear protein Ran, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RanP62827 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RanP62827 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RanP62827 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RanP62827 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RanP62827 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RanP62827 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RanP62827 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RanP62827 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RanP62827 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RanP62827 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RanP62827 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RanP62827 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RanP62827 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RanP62827 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RanP62827 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RanP62827 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RanP62827 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RanP62827 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms