Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabra1P62812 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gabra1P62812 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms