Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Snrpd2P62317 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snrpd2P62317 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snrpd2P62317 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms