Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rps29P62274 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps29P62274 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps29P62274 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms