Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smg6P61406 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Smg6P61406 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smg6P61406 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smg6P61406 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smg6P61406 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smg6P61406 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smg6P61406 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smg6P61406 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms