Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sem1P60897 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sem1P60897 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sem1P60897 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sem1P60897 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms