Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CgnP59242 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CgnP59242 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CgnP59242 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CgnP59242 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CgnP59242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CgnP59242 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CgnP59242 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CgnP59242 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CgnP59242 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CgnP59242 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CgnP59242 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CgnP59242 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CgnP59242 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CgnP59242 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CgnP59242 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CgnP59242 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CgnP59242 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CgnP59242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CgnP59242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CgnP59242 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CgnP59242 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CgnP59242 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CgnP59242 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CgnP59242 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CgnP59242 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CgnP59242 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CgnP59242 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CgnP59242 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CgnP59242 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CgnP59242 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CgnP59242 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CgnP59242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms