Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nphp4P59240 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Nphp4P59240 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp4P59240 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms