Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scarf2P59222 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Scarf2P59222 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms