Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paxbp1P58501 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Paxbp1P58501 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms