Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd4P58467 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd4P58467 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd4P58467 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd4P58467 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Setd4P58467 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Setd4P58467 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms