Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdsp1P58466 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdsp1P58466 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms