Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtnsP57757 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CtnsP57757 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CtnsP57757 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CtnsP57757 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CtnsP57757 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CtnsP57757 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms