Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp25P57080 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp25P57080 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp25P57080 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp25P57080 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp25P57080 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp25P57080 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp25P57080 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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