Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdcd5P56812 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdcd5P56812 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdcd5P56812 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms