Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctbp2P56546 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctbp2P56546 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms