Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CckbrP56481 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CckbrP56481 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms