Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gp1bbP56400 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1bbP56400 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms