Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp5P56399 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp5P56399 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp5P56399 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp5P56399 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms