Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dsc2P55292 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dsc2P55292 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms